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姓 名:刘立伟 性 别:男 国 籍:中国 学 位:博士 职 称:教授 专 业:应用数学 工作单位:理学院 出生年月:1980年5月 从事教育工作时间:2008年7月 是否有教师资格:有 E-mail:liutree80@163.com 教育经历: 1999.09-2003.07 东北大学信息与计算科学专业 学士 2003.09-2008.06 大连理工大学应用数学专业 博士研究生 工作经历: 2008.07- 大连交通大学理学院 教师 2014.04-2015.04 日本 京都大学 访问学者 主要研究成果: 研究方向: 1深度学习:深度学习是机器学习领域中一个新的研究方向,是神经网络技术的一种,主要应用深度学习预测生物信息学问题。 2生物信息学:生物信息学综合利用数学、计算机科学来揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。我们的研究目标是生物数据,使用的工具方法是数学、计算机,主要进行基于数学、信息科学基础理论(包括算法理论、机器学习理论)的生物信息学研究。这不仅仅是利用现有理论和算法去解决生物学问题,还针对特定生物学问题而建立数学模型,进行理论分析和算法开发,并应用到实际的生物数据。 3生物医学大数据处理:癌症术后复发预测、癌症术后生存分析等。 论文: 1.Liu L, Wei Y, Zhang Q, et al. SSCRB: Predicting circRNA-RBP interaction sites using a sequence and structural feature-based attention model[J]. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2024. (SCI) 2.Liu L, Wei Y, Tan Z, et al. Predicting circRNA-RBP Binding Sites Using a Hybrid Deep Neural Network[J]. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2024: 1-14. (SCI) 3.Liu L, Zhang Q, Wei Y, et al. A Biological Feature and Heterogeneous Network Representation Learning-Based Framework for Drug–Target Interaction Prediction[J]. Molecules, 2023, 28(18): 6546. (SCI) 4.刘立伟, 么会丽. 利用改进的 3DMax 算法重构染色体 3D 结构[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2021, 19(4). 5. Liu, Liwei; Mori, Tomoya; Zhao, Yang; Hayashida, Morihiro; Akutsu, Tatsuya. Euler String-Based Compression of Tree-Structured Data and its Application to Analysis of RNAs. Current Bioinformatics, 2018, 13(1), pp. 25-33. (SCI), 6. 刘立伟,刘铁晖(2017)一种新的RNA二级结构三维图形表示及其应用. 生物信息学, 15, 55-58. 7. Liu L, Li C, Bai F, et al. An optimization approach and its application to compare DNA sequences[J]. Journal of Molecular Structure, 2015, 1082:49-55.(SCI) 8. Liu L, Li D, Bai F. A relative Lempel–Ziv complexity: Application to comparing biological sequences[J]. Chemical Physics Letters, 2012, 530: 107-112.(SCI) 9. Liu L, Yuan C, Min C. Protein Structural Class Assignment Based on a Mixed Method[J]. Match Communications in Mathematical & in Computer Chemistry, 2011, 65(2):433-444.(SCI) 10. Yuan C X, Liu L W, Wang T M, et al. On property of the invariant of graphical representations of DNA sequences[J]. Journal of Mathematical Chemistry, 2008, 43(3):1177-1183. (SCI) 11. Liu L, Wang T. On 3D graphical representation of RNA secondary structures and their applications[J]. Journal of Mathematical Chemistry, 2007, 42(3): 595-602. (SCI) 12. Liu L, Wang T. Novel characterization of the folding of proteins[J]. International Journal of Quantum Chemistry, 2007, 107(10):1970-1974. (SCI, EI) 13. Liu L, Wang T. Comparison of TOPS strings based on LZ complexity[J]. Journal of Theoretical Biology, 2008, 251(1):159. (SCI) 14. Liu L, Wang T. 2D representation of protein secondary structure sequences and its applications[J]. Journal of Computational Chemistry, 2010, 27(11):1119-1124.(SCI, EI)
项目: [1].pre-miRNA的Dicer酶切位点预测中的核方法研究,中国博士后科学基金,2018.05-2019.08, [2].昆虫RNA干扰的dsRNA分子设计及代谢动力学研究,国家自然基金面上项目,2021.01-2024.12,参加(2/10)
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